Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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ITGB3BPQ13352 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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