Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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