Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SKP2Q13309 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SKP2Q13309 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SKP2Q13309 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SKP2Q13309 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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