Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
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