Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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