Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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