Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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