Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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GRIK3Q13003 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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GRIK3Q13003 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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GRIK3Q13003 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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