Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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