Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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