Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms