Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLEQ07864 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms