Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms