Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms