Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A2Q05940 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms