Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms