Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms