Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A11Q02978 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms