Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC089998.4-201ENST00000552532 459 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LINC01965-201ENST00000412112 1378 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms