Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms