Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms