Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms