Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms