Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKL1Q00532 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms