Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms