Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO4P61968 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO4P61968 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO4P61968 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO4P61968 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO4P61968 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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