Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXYD4P59646 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms