Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms