Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms