Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLTPP55058 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLTPP55058 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLTPP55058 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLTPP55058 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLTPP55058 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms