Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms