Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms