Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms