Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LUMP51884 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms