Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms