Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms