Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms