Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms