Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP1P29466 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP1P29466 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP1P29466 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP1P29466 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP1P29466 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP1P29466 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP1P29466 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP1P29466 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP1P29466 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP1P29466 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP1P29466 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP1P29466 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP1P29466 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms