Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTKP29376 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTKP29376 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTKP29376 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTKP29376 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTKP29376 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTKP29376 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTKP29376 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTKP29376 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTKP29376 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms