Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms