Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms