Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms