Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms