Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms