Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HRCP23327 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HRCP23327 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HRCP23327 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HRCP23327 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms