Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms