Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALB2P22676 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALB2P22676 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms