Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL1P22362 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms