Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD247P20963 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD247P20963 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD247P20963 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD247P20963 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CD247P20963 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD247P20963 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD247P20963 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms